BTI struktūra Institute veikia šie akademiniai padaliniai: Amiloidų tyrimo sektorius Baltymų-nukleorūgščių sąveikos tyrimų skyrius Bioinformatikos skyrius Biotermodinamikos ir vaistų tyrimų skyrius DNR modifikacijos tyrimų skyrius Epigenominių tyrimų laboratorija Eukariotų genų inžinerijos skyrius Imunologijos skyrius Kristalografijos ir cheminės informatikos skyrius Pavienių ląstelių analizės skyrius Taikomosios biokatalizės sektorius