Tyrimų kryptys
Imunologijos skyriuje (ILS) vystomos šios tyrimų kryptys: monokloninių ir rekombinantinių antikūnų kūrimas, antikūnų inžinerija, rekombinantinių alergenų bei virusinių antigenų tyrimai, virusų diagnostika ir paplitimo tyrimai (A. Žvirblienė, I. Kučinskaitė-Kodzė, M. Simanavičius, D. Stravinskienė, A. Sližienė), makrofagų aktyvacijos mechanizmų tyrimai (A. Lučiūnaitė, I. Dalgėdienė), bakterijų virulentiškumo veiksnių tyrimai (M. Plečkaitytė, K.Bielskė).
ILS turi įrangą darbui su ląstelių kultūromis, imunocheminei analizei, imunofluorescencinei mikroskopijai, tėkmės citometrijai, molekulinės biologijos eksperimentams. 
Monokloninių antikūnų kūrimas ir tyrimai
ILS turi ilgametę patirtį monokloninių antikūnų kūrimo, taikymo ir tyrimų srityje. Skyriuje sukurta per 1000 unikalių hibridomų, sekretuojančių monokloninius antikūnus prieš įvairius antigenus: virusų ir bakterijų baltymus, rekombinantinius citokinus, ląstelių receptorius, alergenus, haptenus (monokloninių antikūnų sąrašas). Šie antikūnai naudojami moksliniams ir taikomiesiems darbams. Taikant įvairius imunocheminius metodus ir monokloninius antikūnus, tiriama rekombinantinių virusinių baltymų antigeninė struktūra, nustatomi jų epitopai, tiriamas jų poveikis įgimtojo imuniteto ląstelėms. Šie tyrimai svarbūs, kuriant naujos kartos imunodiagnostikos priemones ir rekombinantines vakcinas.
ILS tyrėjų grupė bendradarbiauja su Vokietijos, JAV, Didžiosios Britanijos, Australijos, Suomijos mokslininkais, dalyvauja tarptautinio tinklo EuroMabNet veikloje.
Rekombinantinių antikūnų kūrimas
Klonuojant antigenams specifiškas antikūnų sekas iš hibridomų bei iš pavienių B ląstelių, kuriami rekombinantiniai antikūnai – viengrandžiai antikūnų fragmentai (scFv, single-chain fragment variable), antikūnai su žmogaus IgG Fc domenu (Fc-scFv) bei chimeriniai antikūnai su pelės imunoglobulinų variabiliąja seka ir skirtingų klasių žmogaus imunoglobulinų pastoviąja seka. Konstruojami naujo tipo multimeriniai rekombinantiniai antikūnai – į virusus panašios dalelės su paviršiuje eksponuotomis sc-Fv arba Fc-scFv sekomis.
Virusinių infekcijų diagnostika ir paplitimo tyrimai
Skyriuje kuriami molekuliniai ir imunologiniai metodai įvairių zoonotinių virusų nustatymui ir tyrimams. Naudojant molekulinius ir serologinius metodus, atlikti žmogaus hepatito E viruso (HEV) paplitimo Lietuvoje tyrimai. Bendradarbiaudami su Lietuvos įmonėmis, ILS mokslininkai prisidėjo prie serologinių metodų, skirtų antikūnų prieš SARS-CoV-2 nustatymui, sukūrimo. COVID-19 pandemijos metu buvo tiriama humoralinio imuninio atsako trukmė po persirgtos SARS-CoV-2 infekcijos, o baigiantis pandemijai - visuomenės imunizacijos lygis. Sukurtos ir apibūdintos monokloninių antikūnų kolekcijos prieš SARS-CoV-2 struktūrinius baltymus, atliekami šių baltymų antigeninių savybių ir jų poveikio imuninėms ląstelėms tyrimai.
Bakterijų virulentiškumo veiksnių tyrimai
Kai kurios bakterijos sintetina toksinus – nuo cholesterolio priklausomus citolizinus, kurie pažeidžia žmogaus ląsteles, formuodami poras jų membranose. ILS sukurta didelė rekombinantinių citolizinų ir jiems specifiškų antikūnų kolekcija, atliekami citolizinų struktūriniai ir funkciniai tyrimai. Sukurtos didelės kolekcijos antikūnų prieš beta-laktamazes, lemiančias bakterijų atsparumą antibiotikams. Šių antikūnų pagrindu sukurti imunologiniai metodai β-laktamazių nustatymui. Molekuliniais metodais atlikti Lietuvoje cirkuliuojančių Neisseria meningitidis ir Streptococcus pneumoniae kamienų tyrimai, įvertinant jų paplitimą, dinamiką bei atsparumą vakcinoms.
Įgimtojo imuniteto ląstelių aktyvacijos mechanizmų tyrimai
Naudojant ląstelių linijas ir pirmines kultūras, tiriamas skirtingos kilmės ir struktūros oligomerinių baltymų, tarp jų ir virusinių antigenų bei jų kompleksų su antikūnais ar nukleorūgštimis poveikis uždegimo procese dalyvaujančioms ląstelėms – makrofagams, fibroblastams, epitelio ląstelėms. Vertinami jų gyvybingumo pokyčiai, uždegiminių citokinų ir chemokinų sekrecijos lygis, NLRP3 inflamasomos aktyvacija ir kiti rodikliai. Tiriamas ir pavienių ląstelių aktyvacijos profilis. Tyrimų rezultatai rodo, kad antigeno struktūrinės ypatybės gali lemti uždegiminės reakcijos intensyvumą ir pobūdį, paveikti tarpląstelinės komunikacijos mechanizmus bei prisidėti prie audinių pažeidimo.
Įrankiai molekulinei alergologijai
Kuriami rekombinantiniai alergenai, antigenine struktūra artimi natūraliems alergenams, bei jų atpažinimui skirti monokloniniai ir rekombinantiniai antikūnai. Šie antikūnai taikomi alergijų in vitro diagnostinių sistemų kūrimui ir optimizavimui. Kuriami chimeriniai antikūnai, sudaryti iš žmogaus ir pelės imunoglobulinų segmentų, turintys pelės antikūnų variabiliąją dalį ir žmogaus IgE ar IgG4 izotipų antikūnų pastoviąją dalį. Tokie antikūnai naudojami kaip standartai molekulinės alergologijos tyrimams. Alergenams specifiški monokloniniai antikūnai taip pat naudojami alergenų ekstraktų sudėties ir kokybės analizei, nustatantt atskiras alergenų molekules. Ši tyrimų kryptis apima ir naujų alergenų identifikavimą. Pirmą kartą nustatytas ir apibūdintas naujas žuvų alergenas – karpio β-enolazė, įtrauktas į tarptautinę alergenų duomenų bazę.
Darbuotojai
| Darbuotojas | Kontaktai | Tyrimų kryptis | Dėstomi kursai | Mokslinės publikacijos |
|
Prof. dr. Aurelija Žvirblienė |
Imunologija, imunotechnologijos, antikūnų kūrimas ir tyrimai, virusų tyrimai, imunodiagnostika |
Imunologija, Imunotechnologijos, Imunologija ir imunotechnologijos, |
 |
|
|
mokslo darbuotoja |
Makrofagų tyrimai, uždegimo ir inflamasomos tyrimai, vėžio imunologija |
|
||
|
Indrė Dalgėdienė jaunesnioji mokslo darbuotoja |
+37052234374 Saulėtekio al. 7, V229 |
Makrofagų aktyvacijos tyrimai, antikūnų kūrimas, tėkmės citometrijos taikymai |
Bendroji biologija, |
|
|
vyresnioji mokslo darbuotoja |
Šeimininko-patogeno sąveikų tyrimai, antikūnų kūrimas ir taikymas imunotechnologijose |
|
||
|
vyresnysis mokslo darbuotojas |
Torque teno viruso (TTV), SARS-CoV-2 ir hepatito E viruso (HEV) tyrimai, antikūnų kūrimas ir taikymas imunotechnologijose |
Molekulinė diagnostika |
|
|
| Dr. Dovilė Stravinskienė
mokslo darbuotoja |
|
Rekombinantinių antikūnų kūrimas, vėžinių antigenų tyrimai naudojant antikūnus |
Imunologija ir imunotechnologijos, Imunotechnologijos |
|
|
mokslo darbuotoja |
|
Alergenų tyrimai |
Imunologija ir imunotechnologijos |
|
|
vyriausioji mokslo darbuotoja |
Vaginalinės mikrobiotos, bakterinių ctolizinų tyrimai, Neisseria meningitidis ir Streptococcus pneumoniae molekuliniai tyrimai |
Pažangios terapijos vaistiniai preparatai |
|
|
|
Karolina Bielskė doktorantė |
|
Bakterijų atsparumo antibiotikams tyrimai |
Molekulinė diagnostika |
|
|
Kristina Mašalaitė doktorantė |
|
Makrofagų aktyvinimo ir uždegimo tyrimai |
Įvadas į molekulinės biologijos laboratoriją |
|
|
Agnė Rimkutė doktorantė |
|
SARS-CoV-2 tyrimai |
Imunologija ir imunotechnologijos |
|
|
Dainius Gudas doktorantas |
|
Rekombinantinių antikūnų kūrimas | |
|
|
Povilas Žukauskas doktorantas |
|
Torque teno viruso (TTV) tyrimai | |
|
|
Uršulė Simonaitytė doktorantė |
Vaginalinės mikrobiotos ir Lactobacillus iners tyrimai | |
||
Publikacijos
2026
Khatmi G, Filipas I, Bielskė K, Šmits K, Peckus D, Klinavičius T, Siddig AA, Fitl P, Novotný M, More-Chevalier J, Tamulevičienė A, Simanavičius M, Tamulevičius T. Laser-made nanoparticle alternatives and machine learning-based image analysis for enhancing lateral flow immunoassay detection of bacterial β-lactamases. Sensors and Actuators B: Chemical. 2026, https://doi.org/10.1016/j.snb.2025.138713.
2025
Rudokas V, Pena-Amelunxen G, Briza P, Aglas L, Zvirbliene A. Evaluation of Inhibitory Activity of Novel Monoclonal Antibodies Against Cat Allergen Fel d 7 and Their Application to Analyse Allergen Extracts. Scand J Immunol. 2025 Sep;102(3):e70056. doi: 10.1111/sji.70056.
Bielskė K, Petraitytė-Burneikienė R, Avižinienė A, Dapkūnas J, Plikusienė I, Juciutė S, Stančiauskaitė M, Žvirblienė A, Kučinskaitė-Kodzė I. Broadly reactive monoclonal antibodies against beta-lactamases for immunodetection of bacterial resistance to antibiotics. Sci Rep. 2025 May 30;15(1):19094. doi: 10.1038/s41598-025-04603-2.
Bielskė K, Simanavičius M, Nuttens J, Armalytė J, Dapkūnas J, Valančauskas L, Žvirblienė A. Novel monoclonal antibodies for immunodetection of AmpC β-lactamases. PeerJ. 2025 Oct 2;13:e20036. doi: 10.7717/peerj.20036.
Bulavaitė A, Dapkūnas J, Reškevičiūtė R, Dalgėdienė I, Valančauskas L, Baranauskienė L, Plečkaitytė M. Gardnerella fibrinogen-binding protein as a candidate adherence factor. Front Cell Infect Microbiol. 2025 May 8;15:1556232. doi: 10.3389/fcimb.2025.1556232.
Grigas J, Spancerniene U, Simanavicius M, Pautienius A, Stankevicius R, Tamosiunas PL, Stankevicius A. Adaptive immune response to a wild boar-derived recombinant hepatitis e virus capsid protein challenge in pigs. Vaccine. 2025 Jan 12;44:126561. doi: 10.1016/j.vaccine.2024.126561.
Juciute S, Maciulis V, Luciunaite A, Liesyte J, Plikusiene I. Comparison of the ACE2 receptor and monoclonal antibodies immobilisation strategies for the sensitive detection of SARS-CoV-2 variants of concern. Anal Chim Acta. 2025 Jul 1;1357:344075. doi: 10.1016/j.aca.2025.344075.
Maciulis V, Lučiūnaitė A, Usvaltas M, Juciute S, Ramanaviciene A, Plikusiene I. The second life for unused COVID-19 vaccines: Towards biosensing application. Talanta. 2025 May 15;287:127647. doi: 10.1016/j.talanta.2025.127647.
McNabb L, McMahon A, Woube EG, Agnihotri K, Colling A, Broder CC, Kucinskaite-Kodze I, Petraityte-Burneikiene R, Bowden TR, Halpin K. Development and Validation of a Differentiating Infected from Vaccinated Animals (DIVA) Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) Strategy for Distinguishing Between Hendra-Infected and Vaccinated Horses. Viruses. 2025 Feb 28;17(3):354. doi: 10.3390/v17030354.
Petrosiute A, Zakšauskas A, Lučiūnaitė A, Petrauskas V, Baranauskienė L, Kvietkauskaitė A, Ščerbavičienė A, Tamošiūnaitė M, Musvicaitė J, Jankūnaitė A, Žvinys G, Stančaitis L, Čapkauskaitė E, Mickevičiūtė A, Juozapaitienė V, Dudutienė V, Zubrienė A, Grincevičienė Š, Bukelskienė V, Schiöth HB, Matulienė J, Matulis D. Carbonic anhydrase IX inhibition as a path to treat neuroblastoma. Br J Pharmacol. 2025 Apr;182(7):1610-1629. doi: 10.1111/bph.17429.
Petrosiute A, Musvicaitė J, Petroška D, Ščerbavičienė A, Arnold S, Matulienė J, Žvirblienė A, Matulis D, Lučiūnaitė A. CCL2-CCR2 Axis Inhibition in Osteosarcoma Cell Model: The Impact of Oxygen Level on Cell Phenotype. J Cell Physiol. 2025 Jan;240(1):e31489. doi: 10.1002/jcp.31489.
2024
Simanavičius M, Kučinskaitė-Kodzė I, Kaselienė S, Sauliūnė S, Gudas D, Jančorienė L, Jasinskienė R, Vitkauskienė A, Žūtautienė R, Žvirblienė A, Stankūnas M. Prevalence of SARS-CoV-2-specific antibodies in a sample of the Lithuanian population-based study in Spring 2023. Heliyon. 2024 Apr 12;10(8):e29343. doi: 10.1016/j.heliyon.2024.e29343.
Lučiūnaitė A, Mašalaitė K, Plikusiene I, Maciulis V, Juciute S, Norkienė M, Žvirblienė A.
Structural properties of immune complexes formed by viral antigens and specific antibodies shape the inflammatory response of macrophages. Cell Biosci. 2024 Apr 25;14(1):53. doi: 10.1186/s13578-024-01237-1.
Rudokas V, Silimavicius L, Kucinskaite-Kodze I, Sliziene A, Pleckaityte M, Zvirbliene A.
Novel monoclonal antibodies against house dust mite allergen Der p 21 and their application to analyze allergen extracts. PeerJ. 2024 Apr 18;12:e17233. doi: 10.7717/peerj.17233
Inciuraite R, Ramonaite R, Kupcinskas J, Dalgediene I, Kulokiene U, Kiudelis V, Varkalaite G, Zvirbliene A, Jonaitis LV, Kiudelis G, Franke A, Schreiber S, Juzenas S, Skieceviciene J. The microRNA expression in crypt-top and crypt-bottom colonic epithelial cell populations demonstrates cell-type specificity and correlates with endoscopic activity in ulcerative colitis. .J Crohns Colitis. 2024 Jul 18:jjae108. doi: 10.1093/ecco-jcc/jjae108
Khatmi G, Klinavičius T, Simanavičius M, Silimavičius L, Tamulevičienė A, Rimkutė A, Kučinskaitė-Kodzė I, Gylys G, Tamulevičius T. Lateral flow assay sensitivity and signal enhancement via laser µ-machined constrains in nitrocellulose membrane. Sci Rep. 2024 Oct 2;14(1):22936. doi: 10.1038/s41598-024-74407-3.
Mačionienė E, Simanavičius M, Vitkauskaitė M, Vickienė A, Staučė R, Vinikovas A, Miglinas M. Urinary Chemokines CXCL9 and CXCL10 Are Non-Invasive Biomarkers of Kidney Transplant Rejection. Ann Transplant. 2024 Oct 15;29:e944762. doi: 10.12659/AOT.944762.
Liustrovaite V, Drobysh M, Ratautaite V, Ramanaviciene A, Rimkute A, Simanavicius M, Dalgediene I, Kucinskaite-Kodze I, Plikusiene I, Chen CF, Viter R, Ramanavicius A. Electrochemical biosensor for the evaluation of monoclonal antibodies targeting the N protein of SARS-CoV-2 virus. Sci Total Environ. 2024 May 10;924:171042. doi: 10.1016/j.scitotenv.2024.171042.
Drobysh M, Liustrovaite V, Kanetski Y, Brasiunas B, Zvirbliene A, Rimkute A, Gudas D, Kucinskaite-Kodze I, Simanavicius M, Ramanavicius S, Slibinskas R, Ciplys E, Plikusiene I, Ramanavicius A. Electrochemical biosensing based comparative study of monoclonal antibodies against SARS-CoV-2 nucleocapsid protein. Sci Total Environ. 2024 Jan 15;908:168154. doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.168154.
Avižinienė A, Dalgėdienė I, Armalytė J, Petraitytė-Burneikienė R. Immunogenicity of novel vB_EcoS_NBD2 bacteriophage-originated nanotubes as a carrier for peptide-based vaccines. Virus Res. 2024 Jul;345:199370. doi: 10.1016/j.virusres.2024.199370.
Bigelyte G, Duchovska B, Zedaveinyte R, Sasnauskas G, Sinkunas T, Dalgediene I, Tamulaitiene G, Silanskas A, Kazlauskas D, Valančauskas L, Madariaga-Marcos J, Seidel R, Siksnys V, Karvelis T. Innate programmable DNA binding by CRISPR-Cas12m effectors enable efficient base editing. Nucleic Acids Res. 2024 Apr 12;52(6):3234-3248. doi: 10.1093/nar/gkae016.
Grincevičienė Š, Vaitkienė D, Kanopienė D, Vansevičiūtė Petkevičienė R, Sukovas A, Celiešiūtė J, Ivanauskaitė Didžiokienė E, Čižauskas A, Laurinavičienė A, Stravinskienė D, Grincevičius J, Matulis D, Matulienė J. Aerobic vaginitis is associated with carbonic anhydrase IX in cervical intraepithelial neoplasia. Sci Rep. 2024 Apr 16;14(1):8789. doi: 10.1038/s41598-024-57427-x.
Silimavicius L, Tchebotarev L, Zaveckas M, Razanskas R, Cepulyte L, Bielske K, Kucinskaite-Kodze I, Griguola L, Linauskiene K, Petraityte-Burneikiene R. Microarray-based evaluation of selected recombinant timothy grass allergens expressed in E. Coli and N. Benthamiana. BMC Biotechnol. 2024 Oct 4;24(1):72. doi: 10.1186/s12896-024-00902-0.
2023
Ivaškevičienė I, Silickaitė J, Mačionienė A, Ivaškevičius R, Bulavaitė A, Gėgžna V, Kiverytė S, Paškevič B, Žvirblienė A, Plečkaitytė M. Molecular characteristics of Neisseria meningitidis carriage strains in university students in Lithuania. BMC Microbiol. 2023; 23(1):352. doi: 10.1186/s12866-023-03111-5.
Drobysh M, Liustrovaite V, Kanetski Y, Brasiunas B, Zvirbliene A, Rimkute A, Gudas D, Kucinskaite-Kodze I, Simanavicius M, Ramanavicius S, Slibinskas R, Ciplys E, Plikusiene I, Ramanavicius A. Electrochemical biosensing based comparative study of monoclonal antibodies against SARS-CoV-2 nucleocapsid protein. Sci Total Environ. 2023; 908:168154. doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.168154.
Lučiūnaitė A, Dalgėdienė I, Vasiliūnaitė E, Norkienė M, Kučinskaitė-Kodzė I, Žvirblienė A, Gedvilaitė A. Immunogenic Properties and Antigenic Similarity of Virus-like Particles Derived from Human Polyomaviruses. Int J Mol Sci. 2023; 24(5):4907. doi: 10.3390/ijms24054907.
Sereikaitė E, Plepytė R, Petrutienė A, Stravinskienė D, Kučinskaitė-Kodzė I, Gėgžna V, Ivaškevičienė I, Žvirblienė A, Plečkaitytė M. Molecular characterization of invasive Neisseria meningitidis isolates collected in Lithuania (2009-2019) and estimation of serogroup B meningococcal vaccine 4CMenB and MenB-Fhbp coverage. Front Cell Infect Microbiol. 2023; 13:1136211. doi: 10.3389/fcimb.2023.1136211
Avižinienė A, Kučinskaitė-Kodzė I, Petraitytė-Burneikienė R, Žvirblienė A, Mertens ML, Schmidt S, Schlegel M, Lattwein E, Koellner B, Ulrich RG. Characterization of a Panel of Cross-Reactive Hantavirus Nucleocapsid Protein-Specific Monoclonal Antibodies. Viruses. 2023;15(2): 532. doi: 10.3390/v15020532.
Sližienė A, Plečkaitytė M, Rudokas V, Juškaitė K, Žvirblis G, Žvirblienė A.
Cross-reactive monoclonal antibodies against fish parvalbumins as a tool for studying antigenic similarity of different parvalbumins and analysis of fish extracts. Mol Immunol. 2023;154: 80-95. doi: 10.1016/j.molimm.2023.01.001
Bakuła Z, Dziurzyński M, Decewicz P, Bakonytė D, Vasiliauskaitė L, Nakčerienė B, Krenke R, Stakėnas P, Jagielski T. Spoligotyping of Mycobacterium tuberculosis - Comparing in vitro and in silico approaches. Infect Genet Evol. 2023; 115:105508. doi: 10.1016/j.meegid.2023.105508.
Bakuła Z, Marczak M, Bluszcz A, Proboszcz M, Kościuch J, Krenke R, Stakėnas P, Mokrousov I, Jagielski T. Phylogenetic relationships of Mycobacterium tuberculosis isolates in Poland: The emergence of Beijing genotype among multidrug-resistant cases. Front Cell Infect Microbiol. 2023, 13:1161905. doi: 10.3389/fcimb.2023.1161905.
2022
Lučiūnaitė A, Dalgėdienė I, Žilionis R, Mašalaitė K, Norkienė M, Šinkūnas A, Gedvilaitė A, Kučinskaitė-Kodzė I, Žvirblienė A. Activation of NLRP3 Inflammasome by Virus-Like Particles of Human Polyomaviruses in Macrophages. Front Immunol. 2022; 13:831815.
Sližienė A, Plečkaitytė M, Zaveckas M, Juškaitė K, Rudokas V, Žvirblis G, Žvirblienė A. (2022). Monoclonal antibodies against the newly identified allergen β-enolase from common carp (Cyprinus carpio). Food and Agricultural Immunology, 33, 129-149
Plikusiene I, Maciulis V, Juciute S, Ramanavicius A, Balevicius Z, Slibinskas R, Kucinskaite-Kodze I, Simanavicius M, Balevicius S, Ramanaviciene A. 2022. Investigation of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein interaction with a specific antibody by combined spectroscopic ellipsometry and quartz crystal microbalance with dissipation. Journal of Colloid and Interface Science 626:113–122.
Drobysh M, Liustrovaite V, Baradoke A, Rucinskiene A, Ramanaviciene A, Ratautaite V, Viter R, Chen C-F, Plikusiene I, Samukaite-Bubniene U, Slibinskas R, Ciplys E, Simanavicius M, Zvirbliene A, Kucinskaite-Kodze I, Ramanavicius A. 2022. Electrochemical Determination of Interaction between SARS-CoV-2 Spike Protein and Specific Antibodies. International Journal of Molecular Sciences 23: 6768.
Grincevičienė Š, Vaitkienė D, Kanopienė D, Vansevičiūtė R, Tykvart J, Sukovas A, Celiešiūtė J, Ivanauskaitė Didžiokienė E, Čižauskas A, Laurinavičienė A, Král V, Hlavačková A, Zemanová J, Stravinskienė D, Sližienė A, Petrošiūtė A, Petrauskas V, Balsytė R, Grincevičius J, Navratil V, Jahn U, Konvalinka J, Žvirblienė A, Matulis D, Matulienė J. Factors, associated with elevated concentration of soluble carbonic anhydrase IX in plasma of women with cervical dysplasia. Sci Rep. 2022;12(1): 15397.
Matulienė J, Žvinys G, Petrauskas V, Kvietkauskaitė A, Zakšauskas A, Shubin K, Zubrienė A, Baranauskienė L, Kačenauskaitė L, Kopanchuk S, Veiksina S, Paketurytė-Latvė V, Smirnovienė J, Juozapaitienė V, Mickevičiūtė A, Michailovienė V, Jachno J, Stravinskienė D, Sližienė A, Petrošiūtė A, Becker HM, Kazokaitė-Adomaitienė J, Yaromina A, Čapkauskaitė E, Rinken A, Dudutienė V, Dubois LJ, Matulis D. Picomolar fluorescent probes for compound affinity determination to carbonic anhydrase IX expressed in live cancer cells. Sci Rep. 2022;12(1): 17644.
Ruta Inciuraite, Rima Ramonaite, Juozas Kupcinskas, Indre Dalgediene, Ugne Kulokiene, Vytautas Kiudelis, Greta Varkalaite, Aurelija Zvirbliene, Laimas Virginijus Jonaitis, Gediminas Kiudelis, Andre Franke, Simonas Juzenas, Jurgita Skieceviciene. Crypt-top and crypt-bottom colonic epithelial cell microRNA profiling reveals cell type-specific response in active and quiescent ulcerative colitis. bioRxiv doi: 10.1101/2022.09.25.22280336
Widerspick L, Vázquez CA, Niemetz L, Heung M, Olal C, Bencsik A, Henkel C, Pfister A, Brunetti JE, Kucinskaite-Kodze I, Lawrence P, Muñoz Fontela C, Diederich S, Escudero-Pérez B. Inactivation Methods for Experimental Nipah Virus Infection. Viruses. 2022;14(5): 1052.
Inga Peciuliene, Egle Jakubauskiene, Laurynas Vilys, Ruta Zinkeviciute, Kotryna Kvedaraviciute, Arvydas Kanopka. Short-term hypoxia in cells induces expression of genes which are enhanced in stressed cells. Genes, 2022, 13, 1596.
KLIMASAUSKAS Saulius, RAKAUSKAITE Rasa, URBANAVICIUTE Giedrė, LASICKIENE Rita, SIMANAVICIUS Martynas, ZVIRBLIENE Aurelija. Antibodies for Photoactive Protein Manipulation. EP21187460.7
Monoclonal antibodies against common carp beta-enolase. Gintautas Zvirblis, Aiste Sliziene, Milda Pleckaityte, Mindaugas Zaveckas. EP4056595A1, 2022-09-14
Monokloniniai antikūnai prieš paprastojo karpio beta enolazę. Gintautas Žvirblis, Aistė Sližienė, Milda Plečkaitytė, Mindaugas Zaveckas. LT 69 62 B, 2022-12-12
2021
Jakubauskienė E, Kanopka A. 2021. Alternative Splicing and Hypoxia Puzzle in Alzheimer’s and Parkinson’s Diseases. Genes 12:1272. DOI: 10.3390/genes12081272.
Kučinskaitė-Kodzė, I., Simanavičius, M., Šimaitis, A., Žvirblienė, A. Persistence of SARS-CoV-2-Specific Antibodies for 13 Months after Infection. Viruses. 2021, 13(11): 2313
McNabb L, Andiani A, Bulavaite A, Zvirbliene A, Sasnauskas K, Lunt R. 2021. Development and validation of an IgM antibody capture ELISA for early detection of Hendra virus. Journal of Virological Methods 298:114296. DOI: 10.1016/j.jviromet.2021.114296.
Yu JC, Mietzsch M, Singh A, Jimenez Ybargollin A, Kailasan S, Chipman P, Bhattacharya N, Fakhiri J, Grimm D, Kapoor A, Kučinskaitė-Kodzė I, Žvirblienė A, Söderlund-Venermo M, McKenna R, Agbandje-McKenna M. 2021. Characterization of the GBoV1 Capsid and Its Antibody Interactions. Viruses 13:330. DOI: 10.3390/v13020330.
Plikusiene I, Maciulis V, Ramanaviciene A, Balevicius Z, Buzavaite-Verteliene E, Ciplys E, Slibinskas R, Simanavicius M, Zvirbliene A, Ramanavicius A. 2021. Evaluation of kinetics and thermodynamics of interaction between immobilized SARS-CoV-2 nucleoprotein and specific antibodies by total internal reflection ellipsometry. Journal of Colloid and Interface Science 594:195–203. DOI: 10.1016/j.jcis.2021.02.100.
Sarantopoulos, A., Brown, D.,Wiedermann, U., Alvarez, C.,Bogdan, C., Gürsel, I., Janković, I., LeClerc,C., Locati, M., Spurkland, A., Regateiro, F., Van Damme, P., Žvirblienė,A., Wensveen, F,M. The EFIS vaccination task force expert report. Eur. J. Immunol. 2021. 51: 1023–1027
2020
Grigas J, Simkute E, Simanavicius M, Pautienius A, Streimikyte–Mockeliune Z, Razukevicius D, Stankevicius A. Hepatitis E genotype 3 virus isolate from wild boar is capable of replication in non–human primate and swine kidney cells and mouse neuroblastoma cells. BMC Vet Res. 2020; 16:95
Rakauskaitė Rasa; Urbanavičiūtė Giedrė; Simanavičius Martynas; Lasickienė Rita; Vaitiekaitė Aušra; Petraitytė Gražina; Masevičius Viktoras; Žvirblienė Aurelija; Klimašauskas Saulius. Photocage-Selective Capture and Light-Controlled Release of Target Proteins. iScience. 2020; 23(12):101833
Lazutka J, Simutis K, Matulis P, Petraitytė-Burneikienė R, Kučinskaitė-Kodzė I, Simanavičius M, Tamošiūnas PL. Antigenicity study of the yeast-generated human parvovirus 4 (PARV4) virus-like particles. Virus Res. 2020; 198236
Kucinskaite–Kodze I, Simanavicius M, Dapkunas J, Pleckaityte M, Zvirbliene A. Mapping of recognition sites of monoclonal antibodies responsible for the inhibition of pneumolysin functional activity. Biomolecules. 2020; 10, 1009
Lučiūnaitė A, McManus RM, Jankunec M, Rácz I, Dansokho C, Dalgėdienė I, Schwartz S, Brosseron F, Heneka MT. Soluble Aβ oligomers and protofibrils induce NLRP3 inflammasome activation in microglia. J Neurochem. 2019 Dec 23:e14945
Mickiene, G., Dalgėdienė, I., Zvirblis, G., Dapkunas, Z., Plikusiene, I., Buzavaite-Verteliene, E., Balevičius, Z., Rukšėnaitė, A., & Pleckaityte, M. (2020). Human granulocyte-colony stimulating factor (G-CSF)/stem cell factor (SCF) fusion proteins: design, characterization and activity. PeerJ, 8, e9788
Bulavaitė A, Dalgediene I, Michailoviene V, Pleckaityte M. Type II Restriction-Modification System from Gardnerella vaginalis ATCC 14018. Pathogens. 2020;9(9):703
Špakova A, Dalgėdienė I, Insodaitė R, Sasnauskienė A, Žvirblienė A, Petraitytė-Burneikienė R. vB_EcoS_NBD2 bacteriophage-originated polytubes as a carrier for the presentation of foreign sequences. Virus Res. 2020 Dec;290:198194
Stravinskiene D, Sliziene A, Baranauskiene L, Petrikaite V, Zvirbliene A. Inhibitory Monoclonal Antibodies and Their Recombinant Derivatives Targeting Surface-Exposed Carbonic Anhydrase XII on Cancer Cells. International Journal of Molecular Sciences. 2020; 21(24):9411
Esser, C., Boots, A.M., Caignard, A., Ciraci, C., Grčević, D., Knapp, S., Montoya, M., Rosa, F.D., Saksida, T., Stravinskiene, D., et al. (2020). The impact of COVID-19 lock-downs for European (female) immunologists – our views as members of the EFIS gender and diversity task force. European Journal of Immunology 50, 1855–1857
2019
Stravinskiene D, Imbrasaite A, Petrikaite V, Matulis D, Matuliene J, Zvirbliene A. New Monoclonal Antibodies for a Selective Detection of Membrane-Associated and Soluble Forms of Carbonic Anhydrase IX in Human Cell Lines and Biological Samples. Biomolecules. 2019 pii: E304. doi: 10.3390/biom9080304
Takkinen K, Žvirblienė A. Recent advances in homogenous immunoassays based on resonance energy transfer. Curr Opin Biotechnol. 2019; 55: 16-22. doi: 10.1016/j.copbio.2018.07.003
Kols, N. I.; Aatola, H.; Peltola, V.; Xu, M.; Nora-Krukle, Z.; Hedman, K.; Zvirbliene, A.; Toivola, H.; Vuorinen, T.; Koskinen, J. M.; et al. Comparison of Phenotypic and Genotypic Diagnosis of Acute Human Bocavirus 1 Infection in Children. J. Clin. Virol. 2019, 120, 17–19.
Stravinskiene, D.; Imbrasaite, A.; Petrikaite, V.; Matulis, D.; Matuliene, J.; Zvirbliene, A. New Monoclonal Antibodies for a Selective Detection of Membrane-Associated and Soluble Forms of Carbonic Anhydrase IX in Human Cell Lines and Biological Samples. Biomolecules 2019, 9 (8), 304.
Ragaliauskas, T.; Plečkaitytė, M.; Jankunec, M.; Labanauskas, L.; Baranauskiene, L.; Valincius, G. Inerolysin and Vaginolysin, the Cytolysins Implicated in Vaginal Dysbiosis, Differently Impair Molecular Integrity of Phospholipid Membranes. Sci. Rep. 2019, 9 (1), 10606.
Peciuliene, I.; Vilys, L.; Jakubauskiene, E.; Zaliauskiene, L.; Kanopka, A. Hypoxia Alters Splicing of the Cancer Associated Fas Gene. Exp. Cell Res. 2019, 380 (1), 29–35.
Asta Lučiūnaitė, Róisín M. McManus, Marija Jankunec, Ildikó Rácz, Cira Dansokho, Indrė Dalgėdienė, Stephanie Schwartz, Frederic Brosseron, Michael T. Heneka. Soluble Aβ Oligomers and Protofibrils Induce NLRP3 Inflammasome Activation in Microglia. J Neurochem. 2019 Dec 23:e14945.
Knygų skyriai:
Stravinskienė, D.; Žvirblienė, A. Development of Therapeutic Antibodies Against Carbonic Anhydrases. In Carbonic Anhydrase as Drug Target; Matulis, D., Ed.; Springer International Publishing: Cham, 2019; pp 305–322.
Imbrasaitė, A.; Stravinskienė, D.; Žvirblienė, A. Detection of Carbonic Anhydrases. In Carbonic Anhydrase as Drug Target; Matulis, D., Ed.; 2019; pp 323–333.
Antikūnų sąrašas
Imunologijos skyriuje sukurtų monokloninių antikūnų sąrašas (EN):
Viral Antigens
mAbs Against Viral Antigens
| Target | Applications Tested | Publications and Additional Information |
| Human hepatitis B virus surface antigen (HBsAg) | ELISA, WB, NA |
Kucinskaite-Kodze et al., Virus Res, 2016, 211:209-21, https://doi.org/10.1016/j.virusres.2015.10.024 |
| Measles virus nucleocapsid protein | ELISA, WB, IFA |
Zvirbliene et al., Arch Virol. 2007, 152: 25-39, https://doi.org/10.1007/s00705-006-0837-5 |
| Mumps virus nucleocapsid protein | ELISA, WB, IFA | Commercially available |
| Human parainfluenza virus (type 1) nucleocapsid protein | ELISA, WB | Commercially available |
| Human parainfluenza virus (type 2) nucleocapsid protein | ELISA, WB, IFA | Bulavaitė et al., Appl Microbiol Biotechnol. 2016, https://doi.org/10.1007/s00253-016-7330-1 |
| Human parainfluenza virus (type 3) nucleocapsid protein | ELISA, WB, IFA |
Zvirbliene et al., Viral Immunol. 2009; 22:181-188, https://doi.org/10.1089/vim.2008.0106 |
| Human parainfluenza virus (type 4) nucleocapsid protein | ELISA, WB, IFA | Bulavaitė et al., Appl Microbiol Biotechnol 101, 2991–3004 (2017). https://doi.org/10.1007/s00253-017-8104-0 |
| Rubella virus capsid protein | ELISA, WB, IFA |
Kučinskaitė et al., Biologija. 2006, 2: 72-75 |
| Hamster polyomavirus major capsid protein VP1 | ELISA, WB |
Zvirbliene et al., J Imm Meth. 2006, 311: 57-70, https://doi.org/10.1016/j.jim.2006.01.007 |
| Mouse polyomavirus major capsid protein VP1 | ELISA, WB | — |
| John Cunningham polyomavirus major capsid protein VP1 | ELISA, WB, ICH |
Lučiūnaitė et al., Int J Mol Sci. 2023, 25:4907, https://doi.org/10.3390/ijms24054907 |
| Human Merkel polyomavirus major capsid protein VP1 | ELISA, WB | Lučiūnaitė et al., Int J Mol Sci. 2023, 25:4907, https://doi.org/10.3390/ijms24054907 |
| Karolinska Institute polyomavirus major capsid protein VP1 | ELISA, WB | Lučiūnaitė et al., Int J Mol Sci. 2023, 25:4907, https://doi.org/10.3390/ijms24054907 |
| Washington University polyomavirus major capsid protein VP1 | ELISA, WB | Lučiūnaitė et al., Int J Mol Sci. 2023, 25:4907, https://doi.org/10.3390/ijms24054907 |
| Human polyomavirus 6 major capsid protein VP1 | ELISA, WB | Lučiūnaitė et al., Int J Mol Sci. 2023, 25:4907, https://doi.org/10.3390/ijms24054907 |
| Human polyomavirus 7 major capsid protein VP1 | ELISA, WB | Lučiūnaitė et al., Int J Mol Sci. 2023, 25:4907, https://doi.org/10.3390/ijms24054907 |
| Human polyomavirus 9 major capsid protein VP1 | ELISA | Lučiūnaitė et al., Int J Mol Sci. 2023, 25:4907, https://doi.org/10.3390/ijms24054907 |
| Saint Louis polyomavirus polyomavirus major capsid protein VP1 | ELISA | Lučiūnaitė et al., Int J Mol Sci. 2023, 25:4907, https://doi.org/10.3390/ijms24054907 |
| Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus major capsid protein VP1 | ELISA, WB |
Gedvilaite at al. Viruses. 2015 7:4204-4229, https://doi.org/10.3390/v7082818 |
| Rabies virus (CSV-11) nucleocapsid protein | ELISA, WB | — |
| Human metapneumovirus nucleocapsid protein | ELISA, WB, IFA | Petraitytė-Burneikienė et al. Virus Res. 2011, 161: 131-139, https://doi.org/10.1016/j.virusres.2011.07.009 |
| Human Bocavirus 1 capsid protein VP2 | ELISA |
Kailasan et al., J Virol. 2016, 90(9):4670-80, https://doi.org/10.1128/jvi.02998-15 |
| Human Bocavirus 2 capsid protein VP2 | ELISA, WB | — |
| Human Bocavirus 3 capsid protein VP2 | ELISA | — |
| Human Bocavirus 4 capsid protein VP2 | ELISA, WB | — |
| Human parvovirus 4 capsid protein | ELISA, WB | Lazutka et al., Virus Res. 2021, 292:198236, https://doi.org/10.1016/j.virusres.2020.198236 |
| Influenza A virus polymerase complex PA subunit | ELISA, WB | Chase et al., PLoS Pathog. 2011 Sep;7(9): e1002187, https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1002187 |
| Influenza A virus nucleoprotein | ELISA, WB | — |
| Influenza B virus nucleoprotein | ELISA, WB | — |
|
Hantavirus nucleocapsid protein |
ELISA, WB, ICH, IFA |
Kucinskaite-Kodze et al., Arch Virol. 2011, 156: 443-456, https://doi.org/10.1007/s00705-010-0879-6 |
| Hantavirus glycoprotein Gc | ELISA, WB, IFA |
Zvirbliene et al., Viruses. 2014, 6(2):640-60, https://doi.org/10.3390/v6020640 |
| Nipah virus nucleocapsid protein | ELISA, WB |
Widerspick et al., Viruses. 2022, 14(5):1052, https://doi.org/10.3390/v14051052 |
| Hendra virus nucleocapsid protein | ELISA, WB | — |
| Menangle virus nucleocapsid protein | ELISA, WB, ICH | Zvirbliene et al. Arch Virol. 2010, 155:13–18, https://doi.org/10.1007/s00705-009-0543-1 |
| Porcine parvovirus capsid protein VP2 | ELISA, WB, IFA | Tamosiunas et al., J Immunol Res. 2014, https://doi.org/10.1155/2014/573531 |
| Porcine circovirus (type 2) capsid protein VP2 | ELISA, WB, IFA | Nainys et al., BMC Biotechnol. 2014, 14:100, https://doi.org/10.1186/s12896-014-0100-1 |
| Rat hepatitis E virus capsid protein | ELISA, WB, IFA |
Simanavicius et al., Appl Microbiol Biotechnol. 2018, 102:185-198, https://doi.org/10.1007/s00253-017-8622-9 |
| Hepatitis E virus genotype 3 capsid protein | ELISA, WB, IFA |
Simanavicius et al., Appl Microbiol Biotechnol. 2018, 102:185-198, https://doi.org/10.1007/s00253-017-8622-9 |
| Schmallenberg virus nucleocapsid protein | ELISA, WB, IFA | Lazutka et al., J Immunol Res. 2014, https://doi.org/10.1155/2014/160316 |
| Schmallenberg virus glycoprotein G2 | ELISA, WB | — |
| SARS-CoV-2 spike protein | ELISA, WB, IFA | Commercially available |
| SARS-CoV-2 spike protein receptor binding domain | ELISA, WB, IFA | Commercially available |
| SARS-CoV-2 nucleoprotein | ELISA, WB, IFA |
Karnitskaya Y et al., Bioelectrochemistry. 2026, https://doi.org/10.1016/j.bioelechem.2025.109090 |
Bacterial Antigens
mAbs Against Bacterial Antigens
| Target | Applications Tested | Publications and Additional Information |
| Gardnerella vaginalis vaginolysin | ELISA, WB, NA |
Zvirbliene et al., Toxicon. 2010, 56: 19-28; EP09788100.7, https://doi.org/10.1016/j.toxicon.2010.03.007 |
| Streptococcus pneumoniae pneumolysin | ELISA, WB, NA | Kucinskaite-Kodze et al., Biomolecules. 2020, 10(7):1009, https://doi.org/10.3390/biom10071009 |
| Streptococcus pyogenes streptolysin O | ELISA, WB, NA | — |
| Streptococcus intermedius intermedilysin | ELISA, WB, NA | — |
| Lactobacillus iners inerolysin | ELISA, WB | — |
| Gardnerella spp. Cna protein | ELISA, WB | Bulavaitė et al., Front Cell Infect Microbiol. 2025, https://doi.org/10.3389/fcimb.2025.1556232 |
| Gardnerella spp. MPR protein | ELISA, WB | — |
| Class C β-lactamase ACT-14 | ELISA, WB | — |
| Class C β-lactamase ADC-144 | ELISA, WB | — |
|
Class C β-lactamases (AmpC) |
ELISA, WB, IP |
Bielskė et al., Sci Rep. 2025, https://doi.org/10.1038/s41598-025-04603-2 |
| Class C β-lactamase CMY-34 | ELISA, WB, IP |
Bielskė et al., PeerJ. 2025, 13:e20036, https://doi.org/10.7717/peerj.20036 |
| Class B β-lactamase NDM-1 | ELISA, WB, IP | — |
| Class C β-lactamase PDC-195 | ELISA, WB | — |
| Class D β-lactamase OXA-48 | ELISA, WB | — |
| Class D β-lactamase OXA-51 | ELISA, WB | — |
| Class D β-lactamase OXA-134 | ELISA, WB | — |
| Class A β-lactamase SHV-42 | ELISA, WB | — |
| Class A β-lactamase SME-3 | ELISA, WB | — |
| Class B β-lactamase VIM-2 | ELISA, WB | — |
| Maltose-binding protein (MBP) | ELISA, WB |
Sližienė et al., Mol Immunol. 2023, 154:80-95, https://doi.org/10.1016/j.molimm.2023.01.001 |
Allergens
mAbs Against Allergens
| Target | Applications Tested | Publications and Additional Information |
| European house dust mite (Dermatophagoides pteronyssinus) allergen Der p 21 | ELISA, WB | Rudokas et al., PeerJ. 2024, 12:e17233, https://doi.org/10.7717/peerj.17233 |
| European house dust mite (Dermatophagoides pteronyssinus) major allergen Der p 23 | ELISA, WB | Determined VH and VL sequences of the mAb 18E5 are available at the ABCD Database: no. ABCD BD771 |
| Domestic cat (Felis domesticus) allergen Fel d 3 | ELISA, WB | — |
| Domestic cat (Felis domesticus) allergen Fel d 7 | ELISA, WB | Rudokas et al., Scand J Immunol. 2025, 102(3):e70056, https://doi.org/10.1111/sji.70056 |
| Domestic dog (Canis familiaris) allergen Can f 2 | ELISA, WB | — |
| Domestic dog (Canis familiaris) allergen Can f 5 | ELISA, WB | — |
| Domestic dog (Canis familiaris) allergen Can f 8 | ELISA, WB | — |
| Common carp (Cyprinus carpio) allergen Cyp c 1 | ELISA, WB | Sližienė et al., Mol Immunol. 2023, 154:80-95, https://doi.org/10.1016/j.molimm.2023.01.001 |
| Common carp (Cyprinus carpio) allergen Cyp c 2 | ELISA, WB |
Sližienė et al., Food and Agricultural Immunol. 2022, 330:129–149, https://doi.org/10.1080/09540105.2022.2028741 |
| Soybean allergen Gly m 4 | ELISA, WB | Determined VH and VL sequences of the mAb 14D1 are available at the ABCD Database: no. ABCD_BD770 |
| Atlantic cod (Gadus morhua) allergen Gad m 1 | ELISA, WB | Sližienė et al., Mol Immunol. 2023, 154:80-95, https://doi.org/10.1016/j.molimm.2023.01.001 |
| Honeybee (Apis mellifera) major allergen Api m 3 | ELISA, WB | — |
| Major apple (Malus domestica) allergen Mal d 1 | ELISA, WB | — |
Human Antigens
mAbs Against Human Antigens
| Target | Applications Tested | Publications and Additional Information |
| Human interferon α2b | ELISA, WB, NA | Commercially available |
| Human interferon γ | ELISA, WB, NA | Commercially available |
| Human granulocyte-colony stimulating factor (G-CSF) | ELISA, WB | — |
| Human growth hormone | ELISA, WB | Commercially available |
| Human α-1 antitrypsin | ELISA, WB | Commercially available |
| Human tumor necrosis factor α | ELISA, WB, NA | Commercially available |
| Human mucin 1 | ELISA, WB, FC |
Zvirbliene et al., J Imm Meth. 2006, 311:57-70, https://doi.org/10.1016/j.jim.2006.01.007 |
|
Human cellular marker p16INK4A |
ELISA, WB | Lasickienė et al., The Scientific Worl Journal. 2012, https://doi.org/10.1100/2012/263737 |
| Human beta amyloid (Aβ1-42) | ELISA, WB, FC, ICC |
Dalgediene et al., J Biomed Sci. 2013, 20:10, https://doi.org/10.1186/1423-0127-20-10 |
| Human carbonic anhydrase IX | ELISA, WB, IHC, FC, IFA |
Stravinskiene et al., Biomolecules. 2019, 9(8):304, https://doi.org/10.3390/biom9080304 |
| Human carbonic anhydrase XII | ELISA, WB, IHC, FC, IFA |
Dekaminaviciute et al., Biomed Res Int. 2014, http://dx.doi.org/10.1155/2014/309307 |
| Human calreticulin | ELISA, WB, IFA, IP | — |
| Human protein disulfide-isomerase A3 (PDIA3/ERp57/GRP58) | ELISA, WB, IFA, IP | — |
| Human endoplasmic reticulum chaperone BiP (GRP78) | ELISA, WB, IFA | — |
| Human calnexin | ELISA, WB, IFA, IP | — |
Other Antigens
mAbs Against other Antigens and Haptens
| Target | Applications Tested | Publications and Additional Information |
| 2,3-dimethyl-2,3-dinitrobutane (DMNB) | ELISA, WB, IP |
Rakauskaitė et al., iScience. 2020, https://doi.org/10.1016/j.isci.2020.101833 |
| Saccharomyces cerevisiae S288C KEX2 |
WB | Commercially available |
ELISA – enzyme linked immunosorbent assay
WB – Western blot
IFA – immunofluosercence microscopy analysis
IHC – immunohistochemistry
FC – flow cytometry
NA – neutralization assay
IP – immunoprecipitation
ICC - immunocytochemistry