Mūsų skyriaus mokslinė veikla nukreipta į kompiuterinių metodų kūrimą ir jų taikymą fundamentinėms biologinėms problemoms spręsti.
1. Kompiuterinių metodų kūrimas
Šioje tyrimų kryptyje siekiame sukurti efektyvius kompiuterinius metodus, skirtus tolimiems baltymų evoliuciniams ryšiams nustatyti, taip pat baltymų ir makromolekulinių kompleksų erdvinėms struktūroms analizuoti, lyginti, modeliuoti ir vertinti. Ypatingą dėmesį skiriame biomolekulių sąveikoms, įskaitant baltymų sąveikas su kitais baltymais, nukleorūgštimis ir mažomis molekulėmis (ligandais). Naujiems bioinformatikos metodams kurti vis plačiau pasitelkiame šiuolaikinius mašininio mokymosi metodus ir dirbtinio intelekto srities pasiekimus. Visa mūsų skyriuje sukurta programinė įranga ir interneto serveriai yra atviros prieigos.
2. Kompiuterinių metodų taikymas biologinėms problemoms spręsti
Šios krypties tyrimai orientuoti į konkrečius biologinius klausimus, pasitelkiant tinkamiausius kompiuterinius metodus, sukurtus tiek mūsų skyriuje, tiek kitur. Daugiausia dėmesio skiriame baltymų ir jų kompleksų evoliucijai, struktūrai bei molekuliniams veikimo mechanizmams. Pagrindinės mūsų tyrimų temos apima DNR replikacijoje, rekombinacijoje, reparacijoje ir mutagenezėje dalyvaujančius baltymus, taip pat prokariotų apsaugos sistemas. Šiuo metu aktyviai tiriame DNR polimerazes, CRISPR–Cas sistemas ir su jomis susijusias RNR valdomas nukleazes, antivirusinės apsaugos signalinius baltymus bei prokariotų Argonaute sistemas, tačiau mūsų tyrimai šiomis temomis neapsiriboja. Daugelį tyrimų atliekame glaudžiai bendradarbiaudami su eksperimentinių tyrimų grupėmis Lietuvoje ir užsienyje. Toks bendradarbiavimas leidžia kompiuteriniais metodais suformuluotas funkcines ir mechanistines hipotezes patikrinti eksperimentais.
Mūsų skyriuje dirba įvairiose srityse - chemijos, biochemijos, informatikos, matematikos - išsilavinimą įgiję žmonės. Ši išsilavinimų įvairovė kuria stimuliuojančią skyriaus aplinką. Kompiuteriniai mūsų skyriaus resursai yra adekvatūs daugumos bioinformatikos uždavinių sprendimui. Kartu paėmus, visa tai sudaro labai geras sąlygas studentų, doktorantų ir jaunų mokslininkų profesiniam tobulėjimui kompiuterinės biologijos/bioinformatikos srityje.
Sudomino galimybė įsijungti į Bioinformatikos skyriaus veiklą (atlikti baigiamąjį bakalauro ar magistro darbą, stoti į doktorantūros studijas)? Prašome atsiųsti el. laiškelį skyriaus vadovui ir pridėti savo CV.