📅 2026 m. spalio 16 d. 🕐 14:30 val. 📍 R401 auditorija, VU GMC
Džiaugiamės galėdami į VU GMC pakviesti Mikel-Iceta Tena, CNB-CSIC (Ispanijos nacionalinio biotechnologijų centro) ir SEMC-NYSBC (Simons elektroninės mikroskopijos centro, Niujorko struktūrinės biologijos centro) doktorantą.
Mikelio mokslinė veikla apima krioelektroninę mikroskopiją ir mokslinės programinės įrangos kūrimą. Jo tyrimai orientuoti į vaizdų apdorojimo taikymą vienos dalelės krioelektroninėje mikroskopijoje (cryo-EM) bei krioelektroninėje tomografijoje (cryo-ET). Jis taip pat kuria naujus metodus ir integruoja juos į Scipion - platformą, leidžiančią sujungti skirtingus programinės įrangos paketus į atkuriamas struktūrinės biologijos duomenų analizės sekas.
Prieš pradėdamas dabartines doktorantūros studijas, Mikelis penkerius metus (2020–2025 m.) dirbo sistemų vadovu CNB-CSIC. Čia jis prisidėjo prie automatizuotų darbo sekų, leidžiančių apdoroti krio-EM duomenis realiuoju laiku jų rinkimo metu, kūrimo, taip pat prie didelio našumo skaičiavimo (HPC) infrastruktūros, skirtos struktūrinei biologijai, projektavimo ir diegimo.
Apie ką išgirsime?
• Vienos dalelės krio-EM analizė (SPA) ir tomografija: įvadas į šiuos metodus ir jų teikiamas galimybes.
• Nuo neapdorotų vaizdų iki biologinės informacijos: įvadas į cryo-EM/cryo-ET duomenų apdorojimą ir skaičiavimo etapus, reikalingus struktūrai nustatyti.
• Scipion: kaip ši platforma leidžia sujungti skirtingus krio-EM programinės įrangos paketus ir kurti integruotas bei atkuriamas duomenų apdorojimo darbo sekas.
• Instruct-ES centras: struktūrinės biologijos infrastruktūros ir galimybių, kurias suteikia Ispanijos „Instruct“ centras, pristatymas.
Nesvarbu, ar jau dirbate su krio-EM, svarstote galimybę šį metodą pritaikyti savo tyrimuose, ar tiesiog norite sužinoti, kaip iš tūkstančių (ar net milijonų!) triukšmingų elektroninės mikroskopijos vaizdų galiausiai gaunama trimatė biologinė struktūra, šis seminaras suteiks puikią progą pažvelgti į tai, kas vyksta „užkulisiuose“.
Pranešėjas: Mikel-Iceta Tena Institucijos: CNB-CSIC & SEMC-NYSBC Seminaro organizatoriai: dr. Giedrė Ratkevičiūtė-Cooper ir dr. Benjamin Cooper
Iki pasimatymo seminare!