Praėję renginiai
2021-07-15
12 val. VU Gyvybės mokslų centro R-401 auditorijoje (Saulėtekio al. 7, LT-10257 Vilnius) Agnė Janonienė gins disertaciją Karboanhidrazės IX slopiklio įtakos ląstelių migracijai ir priešvėžinio poveikio nanosistemų tiksliniam pristatymui įvertinimas. Mokslinė vadovė – dr. Vilma Petrikaitė.
Disertacijos anotacija: Vėžiniai susirgimai išlieka viena didžiausių pasaulinio lygio sveikatos problemų, kasmet nusinešančių milijonus žmonių gyvybių, ir jos gydymui reikia naujų strategijų. Baltymas karboanhidrazė IX (CA IX) yra patrauklus taikinys naujų priešvėžinių vaistų kūrime, randamas daugelyje rūšių kietųjų navikų.
Be savo pagrindinės funkcijos, katalizuojant grįžtamą anglies dioksido hidratacijos reakciją, CA IX taip pat dalyvauja ir vėžinių ląstelių metastazavime. Todėl disertacijoje tiriamas slopiklio VD11-4-2, pasižyminčio itin dideliu afiniškumu CA IX, poveikis krūties vėžio ląstelių migracijai. Tyrimai buvo atliekami sekant pavienių ląstelių judėjimą, vertinant jų greitį ir judėjimo kryptingumą. Toks tyrimo modelis buvo pirmą kartą taikomas CA IX slopiklių antimigraciniam poveikiui tirti.
Taip pat disertacijoje pirmą kartą tirtas slopiklio VD11-4-2, kaip CA IX ląstelėse atpažįstančios dalies, taikymas nanosistemose. CA IX yra patrauklus taikinys tikslinėms vaistus pristatančioms sistemoms, nes yra transmembraninis baltymas su aktyviuoju centru, nukreiptu į išorinę ląstelės pusę. VD11-4-2 buvo prijungtas prie porėto silicio ir cinko-vario oksido pagrindu pagamintų nanodalelių paviršiaus, įvertintas nanosistemų jungimais su CA IX bei priešvėžinis poveikis krūties vėžio ląstelėms. Kadangi VD11-4-2 pasižymi fluorescencinėmis savybėmis, taip pat tirtas porėto silicio nanodalelių pagrindu pagamintų nanosistemų patekimas į krūties vėžio ląsteles ir priešvėžinio vaisto atsipalaidavimas jose.
Apibendrinant, disertacijoje aprašomas darbas atskleidžia CA IX, kaip priešvėžinio taikinio, privalumus bei praplečia slopiklio VD11-4-2 pritaikymo galimybes.
Disertacijos gynimą stebėti galite naudodamiesi šia nuoroda.
2021-07-01
11 val. VU Gyvybės mokslų centro R-401 auditorijoje (Saulėtekio al. 7, LT-10257 Vilnius) Lina Aitmanaitė gins disertaciją Virusų suderinamumo tyrimai Saccharomyces cerevisiae LA ir M virusinėse sistemose. Mokslinis vadovas – prof. dr. Saulius Serva.
Disertacijos anotacija: Saccharomyces cerevisiae ir kitose Saccharomyces genties mielėse aptinkama keletas įvairių RNR virusų. Itin didelio susidomėjimo sulaukę Totiviridae šeimai priskiriami dgRNR LA ir nuo jų priklausomi satelitiniai M virusai. Šių virusų sistema suteikia mielėms šeimininkėms žudymo fenotipą. Įprastai gamtoje tam tikro tipo M virusas palaikomas jam savito LA viruso. Tiek LA virusų tarpusavio sąveikos, tiek ir sąveikos su M virusais nėra suprastos, o jų determinantės nežinomos. Šių sąveikų atskleidimas yra svarbus ne tik biocidinio mielių fenotipo supratimui, bet ir bendriems virusų ontogenezės mechanizmams išaiškinti. Disertacijoje aprašomi skirtingų LA virusų rekombinantinių baltymų sudaromų kapsidžių sąveikos su natyviomis LA ir M virusinėmis sistemomis tyrimai. Pristatomas universalus LA ir M virusų eliminacijos iš ląstelių-šeimininkių metodas. Šiame darbe sistematikai įvertintos skirtingų LA virusų kapsidinių baltymų sąveikos su visoms iki šiol žinomomis S. cerevisiae aptinkamomis LA ir M virusų sistemomis, bei viena S. paradoxus LA ir M virusų sistema. Nustatyta, jog LA virusų koduojamų baltymų sąveikos su endogeniniais LA ir M virusais specifiškumas gali būti susietas su rekombinantinių baltymų gebėjimu atpažinti konkrečius M virusus ir taip užtikrinti jų genomo replikaciją. Įvertinta LA virusų baltymų variabilių sekų reikšmė baltymų funkcijų palaikymui bei specifinių sąveikų su satelitiniais virusais susidarymui.
Disertacijos gynimą stebėti nuotoliniu būdu naudojantis šia nuoroda https://tinyurl.com/3knmyxpw
2021-07-01
13 val. VU Gyvybės mokslų centro R-401 auditorijoje (Saulėtekio al. 7, LT-10257 Vilnius) Aušrinė Nestarenkaitė gins disertaciją Imuninio atsako storosios žarnos vėžio mikroaplikoje vertinimas skaitmeninės patologijos analitikos metodais. Mokslinė vadovė – dr. Aida Laurinavičienė. Mokslinė konsultantė – prof. dr. Sonata Jarmalaitė.
Disertacijos anotacija: Naviką infiltruojantys limfocitai (NIL) siejami su pacientų klinikine ligos eiga ir išgyvenamumu, sergant skirtingo tipo vėžiais. Automatizuotam kiekybiniam NIL pasiskirstymo audinyje vertinimui taikomi skaitmeninės imunohistochemijos (IHC) metodai. Šiame darbe pristatoma nauja skaitmeninės vaizdo analizės duomenų apdorojimu erdvinės šešiakampių gardelės analitikos principais pagrįsta metodika, kuria nustatoma naviko ir stromos sąveikos zona ir joje matuojami NIL tankio profiliai. Sukurti naujo tipo imuninio atsako rodikliai, išreiškiantys absoliutų NIL tankį ir jų tankio gradientą (imunogradientą) kryptimi iš stromos į naviką sąveikos zonoje. Rodiklių prognozinė vertė tirta dviejose nepriklausomose storosios žarnos vėžiu sirgusių pacientų, gydytų Vilniaus ir Notingamo (Jungtinė Karalystė) sveikatos priežiūros institucijose, imtyse. Citotoksinių T ląstelių (CD8) imunogradientas (abiejose imtyse), B ląstelių (CD20) imunogradientas ir histologinis naviko augimo pobūdis (Notingamo imtyje) buvo nepriklausomi prognoziniai pacientų bendrojo išgyvenamumo veiksniai, informatyvesni negu absoliutaus NIL tankio naviko mikroaplinkoje rodikliai ir standartiniai klinikiniai, patologiniai ir molekuliniai rodikliai. Pasiūlyti keli kombinuoti prognoziniai įverčiai: 1) CD8–CD20 imunogradiento įvertis, pagrįstas tik CD8 ir CD20 IHC žymenimis, 2) imuninės sąveikos įvertis, kuris integruoja CD8, CD20 IHC žymenis ir histologinį naviko augimo pobūdžio kriterijų. Šie įverčiai buvo nepriklausomi nuo storosios žarnos vėžio mikrosatelitų nestabilumo požymių.
Disertacijos gynimą stebėti nuotoliniu būdu galite naudodamiesi šia nuoroda.
2021-06-30
10 val. VU Gyvybės mokslų centro R-401 auditorijoje (Saulėtekio al. 7, LT-10257 Vilnius) Arūnas Krikštaponis gins disertaciją 7-Hidroksikumarino katabolizmo Pseudomonas mandelii 7HK4 bakterijose tyrimas. Mokslinis vadovas prof. dr. Rolandas Meškys.
Disertacijos anotacija: Kumarinai yra gerai žinomi antriniai metabolitai, kurių yra gausu įvairiuose augaluose. Tačiau šių junginių skaidymo keliai dirvožemio mikroorganizmuose nėra detaliai ištirti. Iš dirvožemio išskirta Pseudomonas mandelii 7HK4 padermė geba skaidyti 7-hidroksikumariną (umbeliferoną), tačiau jo transformacijas katalizuojantys fermentai nėra žinomi. Norėdami išaiškinti 7-hidroksikumarino katabolizmo kelią, RT-PGR ir baltymų MS-MS analizių metodais buvo nustatyti 7-hidroksikumarinu indukuojami genai hcdA, hcdB, hcdC, hcdD, hcdE, hcdF ir hcdG. Genominės DNR fragmentas, koduojantis tariamą alkoholio dehidrogenazę HcdE, buvo klonuotas ir nustatyta, jog rekombinantinis baltymas katalizuoja nuo NADPH priklausomą 7-hidroksikumarino redukciją tiek in vivo, tiek in vitro. Reakcijos produktas buvo išskirtas ir apibūdintas kaip 7-hidroksi-3,4-dihidrokumarinas. Tačiau pastarasis junginys toliau hidrolizuojasi vandeniniame tirpale, susidarant 3-(2,4-dihidroksifenil) propano rūgščiai, remiantis HPLC-MS ir BMR analizėmis. Taip pat, bioinformatinė analizė parodė, kad hcdABC genai koduoja flaviną rišančią hidroksilazę (HcdA), ekstradiolio dioksigenazę (HcdB) ir tariamą hidroksimukoninę semialdehido hidrolazę (HcdC). Rekombinantinio HcdA aktyvumo in vitro analizė patvirtino, kad šis fermentas priklauso ipso-hidroksilazių grupei. Baltymų HcdB ir HcdC aktyvumas buvo analizuojamas naudojant rekombinantines E. coli ląsteles. Nustatyti tarpiniai metabolitai leido patvirtinti numatomas fermentų funkcijas ir apibūdinti 7-hidroksikumarino skaidymo kelią Pseudomonas mandelii 7HK4 bakterijose per tarpinį 3-(2,4-dihidroksifenil) propano rūgšties junginį. HcdA katalizuoja 3-(2,4-dihidroksifenil) propano rūgšties konversiją į 3-(2,3,5-trihidroksifenil) propano rūgštį, atliekant hidroksilinimą ipso pozicijoje, po kurio vyksta vidinis alkilo fragmento (1,2-C,C) poslinkis. Tada, dalyvaujant HcdB fermentui, įvyksta paskesnis oksidacinis aromatinio žiedo meta skėlimas, susidarant atitinkamam linijiniam produktui (2E,4E) -2,4-dihidroksi-6-oksonona-2,4-dieno dirūgščiai. Šiame darbe aprašytas Pseudomonas mandelii 7HK4 bakterijos, galinčios skaidyti 7-hidroksikumariną per 3-(2,4-dihidroksifenil) propano rūgšties tarpinį produktą.
Disertacijos gynimą stebėti nuotoliniu būdu galite naudodamiesi šia nuoroda.
2021-06-04
11 val.VU Gyvybės mokslų centro R-401 auditorijoje (Saulėtekio al. 7, LT-10257 Vilnius) Martynas Simanavičius gins disertaciją Hepatito E viruso diagnostika ir paplitimo tyrimai. Mokslinė vadovė dr. Indrė Kučinskaitė-Kodzė.
Disertacijos anotacija: Hepatitas E yra infekcinė liga, kurią sukelia hepatito E virusas (HEV). HEV genotipas 1 (HEV-1) ir HEV-2 infekuoja tik žmones, o HEV-3 ir HEV-4 – žmones ir kitus žinduolius, pavyzdžiui, kiaules, šernus, elnius, triušius. Ekonomiškai silpnai išsivysčiusioms šalims būdingos HEV-1 ir HEV-2 infekcijos, kurios plinta per užterštą vandenį. HEV-3 yra zoonotinis virusas, jis būdingas ekonomiškai išsivysčiusioms šalims. Šio viruso infekcijos pagrindinis šaltinis yra blogai termiškai apdoroti mėsos produktai. Neseniai buvo nustatytas žiurkių HEV kaip naujas hepatito E sukėlėjas žmonėms. Todėl šio viruso tyrimams reikalingų specifinių įrankių poreikis turėtų išaugti. Disertacijoje aprašytas monokloninių antikūnų (MAk) kūrimas panaudojant mielėse susintetintus HEV-3 ir žiurkių HEV kapsidės baltymus, kurie formuoja virusą primenančias daleles. MAk detaliai apibūdinti ištiriant jų savybes. Tokia MAk prieš HEV kolekcija aprašyta pirmą kartą. Tai suteikia galimybę modeliuoti ir išbandyti potencialiai našesnes ir plačiau pritaikomas HEV tyrimo metodikas. MAk ir rekombinantiniais HEV kapsidės baltymai pritaikyti HEV paplitimo tyrimams laukinių žiurkių, kiaulių ir žmonių mėginiuose. Disertacijos metu pirmą kartą buvo ištirtas HEV paplitimas žmonėse bei laukinėse žiurkėse Lietuvoje.
Disertacijos gynimą stebėti nuotoliniu būdu galite naudodamiesi šia nuoroda.
2021-03-16
15 val., Gediminas Drabavičius gins disertaciją “CRISPR-Cas sistemų tyrimai ir taikymai”, moksliniai vadovai – dr. Giedrius Gasiūnas ir prof. dr. Dirk Daelemans. Disertacija rengta jungtinėje Vilniaus universiteto ir Leveno katalikiškajo universiteto doktorantūroje įgyvendinant individualų doktoranto darbo planą.
Disertacijos gynimą stebėti nuotoliniu būdu naudodamiesi šia nuoroda: https://tinyurl.com/y7a5srzl