Vadovo vardas ir pavardė: Maria Fernanda Torres Jimenez
Institucija (Įmonė), Padalinys: VU GMC BMI
Preliminari tema: Grybų įvairovės Lietuvos negyvojoje medienoje analizė naudojant metagenomiką
Trumpas praktikos aprašymas, darbo pobūdis: Šis projektas tiria grybų, gyvenančių negyvoje medienoje įvairiose Lietuvos vietovėse, įvairovę. Naudojant ONT ilgųjų skaitymų sekvenavimą, projektas siekia apibūdinti grybų bendrijų sudėtį ir palyginti įvairovės modelius skirtingose vietovėse. Projektas apima tiek laboratorinius, tiek kompiuterinius metodus. Laboratorijoje studentas atliks DNR išskyrimą iš medienos ir paruoš mėginius sekvenavimui. Kompiuterinėje dalyje studentas prisidės prie bioinformatikos analizės sistemos kūrimo, skirtos metagenominiam surinkimui ir grybų sekų taksonominiam priskyrimui. Pretendentai turėtų turėti patirties DNR išskyrimo srityje (darbas su sunkiai apdorojamais mėginiais yra pageidautinas, bet nebūtinas) bei bendrųjų molekulinės biologijos metodų išmanymą. Projekto metu studentas įgis pagrindinės patirties bioinformatikos srityje; vis dėlto pageidautina, kad jis būtų susipažinęs su programavimo pagrindais.
Reikalavimai praktikantui: Magistrantas(-ė) Turintis(-i) magistro laipsnį
Pasiūlymas galioja iki: 2025-11-30