Trumpas aprašymas: GridION yra lanksti, vidutinio našumo ilgų fragmentų sekoskaitos įranga. Sistema yra patogi naudoti, paprastai nustatoma ir lengvai valdoma. GridION tinkama virusų, prokariotų ir mažų eukariotų genomų ar metagenomų daugialypei sekoskaitai..
Gamintojas: Oxford Nanopore
Informacija apie įrangą:
Funkcijos:
- 5 nepriklausomos sekoskaitos kasetės
- Iki 240 Gb bendras našumas
- Vidutinė fragmentų ilgis iki 20Kb
- Integruota kompiuterinė sistema: realaus laiko analizė įrenginyje
- Tiesioginis DNR ir RNR modifikacijų nustatymas
Taikymai:
- Bakterinė metagenomika
- Bakterijų viso genomo sekoskaita
- Virusų amplikonų sekoskaita
- Pilno ilgio 16S rRNR sekoskaita
- Viso egzomo sekoskaita
- Viso transkriptomo (cDNA) sekoskaita
- Tiesioginė RNR sekoskaita
Techninės specifikacijos: GridION Mk1 Technical Specification
VU ID:
Patalpa: BVI 215
Laboratorija: Sekoskaitos ir bioinformatikos
Su įranga dirba tik dedikuotas specialistas (operatorius): Taip
Su įranga leidžiama dirbti savarankiškai po supažindinimo su darbo procesu vietoje: Taip
Su įranga leidžiama dirbti tik turintiems tinkamą sertifikatą/patistį: Ne
Yra galimybė dalyvauti įrangos naudojimo mokymuose: Taip
Atsakingas asmuo (laboratorijos vadovas):
Dr. Giancarlo Russo