Pandemija koreguoja renginių formatus, tačiau negali sutrukdyti GMC mokslininkams siekti aukštų rezultatų. Lapkričio 30 – gruodžio 4 dienomis vykusio pasaulinio baltymų struktūros modeliavimo konkurso CASP (angl. Critical Assessment of protein Structure Prediction) baigiamojoje konferencijoje paaiškėjo, kad Vilniaus universiteto Gyvybės mokslų centro (VU GMC) bioinformatikų komanda baltymų kompleksų struktūrų modeliavimo kategorijoje užėmė antrąją vietą.
Komandą sudarė dr. Česlovas Venclovas, dr. Justas Dapkūnas ir dr. Klimentas Olechnovičius.
Kas dvejus metus rengiamas CASP konkursas skirtas pasauliniu mastu įvertinti baltymų struktūrų modeliavimo lygį. 2018 m. VU GMC komanda šiame konkurse užėmė pirmąją vietą.
Pasak lietuvių mokslininkų komandos vadovo dr. Č. Venclovo, konkurso metu visiems dalyviams duodamos vienodos užduotys – nusakyti tų pačių baltymų struktūrą. Tai daroma “aklo testavimo” principu. Dalyviai nežino struktūrų, o tai leidžia objektyviai palyginti skirtingų grupių siūlomus baltymų struktūrų nusakymo metodus.
Mokslininkas pažymėjo, kad šiemet CASP pagrindinėje, individualių baltymų struktūros modeliavimo, kategorijoje triumfavo „DeepMind“ komanda (AlphaFold2), kuri naudojo dirbtinį intelektą. Jų sukonstruotų kompiuterinių modelių tikslumas prilygsta eksperimentui. Daugelio ekspertų nuomone, jų rezultatai reiškia, kad apie 50 metų gyvavusi baltymų struktūros nusakymo problema didžiąja dalimi yra išspręsta.
„CASP14 „DeepMind“ rezultatai sulaukė didelio susidomėjimo geriausiuose mokslo žurnaluose bei įvairių šalių žiniasklaidoje. Tai rodo milžinišką pasaulinį susidomėjimą dirbtinio intelekto panaudojimo galimybėmis“ - sako VU GMC komandos vadovas.
Pasak dr. Č. Venclovo, „DeepMind“ nedalyvavo baltymų kompleksų nusakymo kategorijoje, todėl neaišku, kokie jų rezultatai būtų buvę šioje kategorijoje. „Nors „DeepMind“ nustebino ne vieną, rankų nuleisti neketiname. Konkurse užimta antroji vieta man suteikia akstiną didžiuotis mūsų komandos indėliu baltymų struktūrų modeliavimo sferoje, o už puikų pasirodymą labiausiai norėčiau padėkoti savo kolegoms Justui ir Klimentui, kurie buvo pagrindiniai šios sėkmės kalviai. Jie vasarą iš tikrųjų ir atliko visą pagrindinį darbą”, - atskleidžia komandos vadovas.
GMC mokslininko teigimu, nors po šių metų renginio teks pergalvoti komandos tyrimų kryptis ir tikslus, tačiau „DeepMind“ pergalė tikrai nesumažino entuziazmo ir noro dalyvauti tolesniuose konkursuose.