Sistemų biologija

Dalyko pavadinimas

Mokslo kryptis kodas

Kamieninis padalinys

Šakinis padalinys (-iai)

Sistemų biologija

Biochemija N004

Gyvybės mokslų centras

Biomokslų institutas

Dalyko apimtis kreditais

10

Studijų būdas

Kreditų skaičius

Studijų būdas

Kreditų skaičius

paskaitos

0

konsultacijos

3

individualus

7

seminarai

1

Kurso tikslai

Išvystyti doktorantų žinias apie ląstelę kaip vieningą sistemą, ląstelinių sistemų tyrimų būdus, tokių tyrimų taikomąsias  ir fundamentines  perspektyvas, gebėjimus integruoti skirtingų mokslo sričių žinias.

Pagrindinės temos

Sistemų Biologijos objektas ir turinys. Objekto apibrėžimas, poreikis ir prielaidos, vystymosi perspektyvos.

DNR sekoskaitos metodai ir pasiekimai. Sekoskaitos apibrėžimas ir ištakos, prieš-industrinė sekoskaita, šiuolaikiniai metodai ir perspektyvios technologijos, DNR sekoskaitos pasiekimai.

Epigenetika. Objekto apibrėžimas, epigenetikos aspektai ir komponentės, svarba ir tyrimų perspektyvos.

Transkriptomika. Objekto apibrėžimas, transkriptominių tyrimo metodai, pritaikymas ir ateities perspektyvos.

Proteomika. Objektas ir tyrimų ištakos, principai ir būdai, pritaikymas, iššūkiai, perspektyvos.

Bioinformatika Sistemų Biologijoje. Bioinformatikos objektas ir pritaikymo būdai, ištakos, tyrimų lygmenys ir modeliavimo problemos, bioinformatikos resursai.

Ląstelės funkciniai tyrimai. Sąveikaujanti ląstelė. Ląstelių teorijos ištakos, turinys ir reikšmė, ląstelės turinio inventorizacija.

Pagrindinė literatūra

• Eberhard O. Voit. A First Course in Systems Biology. Garland Science, Taylor & Francic Group, LLC. ISBN 978-0-8153-4467-4. 2013.
• Edda Klipp et al. Systems Biology. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA ISBN: 978-3-527-31874-2. 2009.
• Bernhard O. Palsson. Systems Biology. Properties of Reconstructed Networks. Cambridge University Press. ISBN: 978-0-521-85903-5. 2010.
• Trends in Biochemical Sciences, Trends in Cell Biology, Nature Reviews, Science  2010-2020.

Vertinimo strategija

Vertinimo kriterijai

Seminaras

Pranešimo seminare trukmė – akademinė valanda (45 min), klausimams skiriama 15 min. Pranešimo metu pristatoma 5-10 straipsnių ar apžvalgų medžiaga.

Saulius Serva

Patvirtinta Gyvybės mokslų centro Doktorantūros mokyklos Tarybos posėdyje 2021-10-14, protokolo Nr. (4.10)600000-KT-....

Tarybos pirmininkė dr. Daiva Baltriukienė