Sidebar

Eukariotų genų inžinerijos skyrius

Tyrimų kryptys

Skyrius atliekami tyrimai apima tris pagrindines kryptis. Didžioji tyrimų dalis skiriama konstruoti įvairių mielių kamienų raiškos sistemoms, analizuoti ekspresuotiems virusiniams nukleokapsidės baltymams bei jų formuojamoms struktūroms, pavyzdžiui, virusą imituojančias dalelės VLP (virus-like particles). Tiriami įvairūs žmogaus ir gyvūnų virusai: poliomos, tymų, parotito, hanta, cirko, Šmalenbergo (Schmallenberg), papilomos ir kiti. Daugeliu atveju nustatyta, kad išgrynintos VLP dalelės pagal imunogenines savybes nenusileidžia natūraliems virusams, tinka jų diagnostikai, vakcinų ir monokloninių antikūnų kūrimui.

Augalų genų inžinerijos tyrimai padeda suprasti augalų signalinių sistemų veikimo molekulinius mechanizmus, sudaro galimybę kurti modelinius augalus su išskirtinėmis antioksidantų savybėmis, atsparumu šalčiui arba viroidams. Biofarmacinės paskirties rekombinantinių baltymų technologijos kuriamos pasinaudojus mielių arba bakterinių raiškos sistemų suteikiamomis galimybėmis, pritaikant išgrynintus terapinės paskirties baltymus naujų, efektyvių biologinių vaistų kurimui. Tyrimams naudojami genų inžinerijos ir molekulinės biologijos metodai: genų klonavimas, sekoskaita, mutagenezė, fermentacija, chromatografija, elektroninė mikroskopija, genų raiška įvairiose eukariotų ir prokariotų sistemose, taip pat kiti biocheminiai, imunologiniai ir biofizikiniai tyrimo metodai.


Publikacijos

  1. Dapkunas Ž, Baranauskas A, Mickienė G, Pleckaitytė M, Zvirblis G. Generation of dimeric single-chain antibodies neutralizing the cytolytic activity of vaginolysin. Electronic Journal of Biotechnology 2017, v.28, p. 52-57, doi: 10.1016/j.ejbt.2017.05.003
  2. Denkovskienė EPaškevičius Š, Werner S, Gleba Y, Ražanskienė A. Inducible Expression of Agrobacterium Virulence Gene VirE2 for Stringent Regulation of T-DNA Transfer in Plant Transient Expression Systems. Mol Plant Microbe Interact. 2015 Nov;28(11):1247-55. doi: 10.1094/MPMI-05-15-0102-R.
  3. Gedvilaite A, Tryland M, Ulrich RG, Schneider J, Kurmauskaite V, Moens U, Preugschas H, Calvignac-Spencer S, Ehlers B. Novel polyomaviruses in shrews (Soricidae) with close similarity to human polyomavirus 12. J Gen Virol. 2017. doi: 10.1099/jgv.0.000948. [Epub ahead of print}
  4. Gedvilaite A., Dorn D.C., Sasnauskas K., Pecher G., Bulavaite A., Lawatscheck R., Staniulis J., Dalianis T., Ramqvist T., Schönrich G., Raftery MJ., Ulrich R. Virus-like particles derived from major capsid protein VP1 of different polyomaviruses differ in their ability to induce maturation in human dendritic cells. Virology, 2006, v. 354 (2), 252-260.
  5. Gedvilaite A., Frommel C., Sasnauskas K., Burkhard M., Ozel M., Behrsing O., Staniulis J., Jandrig B., Scherneck S., Ulrich R. Formation of Immunogenic Virus-like Particles by Inserting Epitopes into Surface-Exposed regions of Hamster Major Capsid Protein // Virology. 2000, v. 273, n. 1, p. 21-35.
  6. Mickiene G, Dalgediene I, Dapkunas Z, Zvirblis G, Pesliakas H, Kaupinis A, Valius M, Mistiniene E, Pleckaityte M. Construction, Purification, and Characterization of a Homodimeric Granulocyte Colony-Stimulating Factor. Mol Biotechnol. 2017 Jul 18. doi: 10.1007/s12033-017-0026-7.
  7. Lazutka, J., Spakova, A., Sereika, V., Lelesius, R., Sasnauskas, K., Petraityte-Burneikiene, R. (2015). Saliva as an alternative specimen for detection of Schmallenberg virus-specific antibodies in bovines. BMC Veterinary Research. 11(1):237
  8. Lazutka, J., Zvirbliene, A., Dalgediene, I., Petraityte-Burneikiene, R., Spakova, A., Sereika, V., Lelesius, R., Wernike, K., Beer, M., Sasnauskas, K. (2014). Generation of Recombinant Schmallenberg Virus Nucleocapsid Protein in Yeast and Development of Virus-Specific Monoclonal Antibodies. Journal of Immunology Research. 2014:160316.
  9. Nainys J, Lasickiene R, Petraityte-Burneikiene R, Dabrisius J, Lelesius R, Sereika V, Zvirbliene A, Sasnauskas K, Gedvilaite A. Generation in yeast of recombinant virus-like particles of porcine circovirus type 2 capsid protein and their use for a serologic assay and development of monoclonal antibodies. BMC Biotechnology 2014 14:100. doi:10.1186/s12896-014-0100-1 847
  10. Nainys J, Timinskas A, Schneider J, Ulrich RG, Gedvilaite A. Identification of Two Novel Members of the Tentative Genus Wukipolyomavirus in Wild Rodents. PLoS One. 2015 Oct 16;10(10):e0140916. doi: 10.1371/journal.pone.0140916. eCollection 2015.
  11. Norkiene M, Stonyte J, Ziogiene DMazeike E, Sasnauskas K, Gedvilaite A. Production of recombinant VP1-derived virus-like particles from novel human polyomaviruses in yeast. BMC Biotechnology. 2015, 15:68. DOI: 10.1186/s12896-015-0187-z
  12. Paškevičius Š, Starkevič U, Misiūnas A, Vitkauskienė A, Gleba Y, Ražanskienė A. Plant-expressed pyocins for control of Pseudomonas aeruginosa. PLoS One. 2017 Oct 3;12(10):e0185782. doi: 10.1371/journal.pone.0185782.
  13. Tamošiūnas, P. L., Petraitytė-Burneikienė, R., Lasickienė, R., Akatov, A., Kundrotas, G., Sereika, V., Lelešius, R., Zvirblienė, A., Sasnauskas, K. (2014). Generation of Recombinant Porcine Parvovirus Virus-Like Particles in Saccharomyces cerevisiae and Development of Virus-Specific Monoclonal Antibodies. Journal of Immunology Research. 2014:573531.
  14. Tamošiūnas, P.L., Petraitytė-Burneikienė, R., Bulavaitė, A., Marcinkevičiūtė, K., Simutis, K., Lasickienė, R., Firantienė, R., Ėmužytė, R., Žvirblienė, A., Sasnauskas, K. (2016). Yeast-generated virus-like particles as antigens for detection of human bocavirus 1-4 specific antibodies in human serum. Applied Microbiology and Biotechnology. 100(11):4935-46.
  15. Valaviciute M, Norkiene M, Goda K, Slibinskas R, Gedvilaite A. Survey of molecular chaperone requirement for the biosynthesis of hamster polyomavirus VP1 protein in Saccharomyces cerevisiae. Arch Virol. 2016. 161(7), 1807-1819. DOI 10.1007/s00705-016-2846-3
  16. Zaveckas M., Snipaitis S., Pesliakas H. Nainys J. Gedvilaite A. Purification of recombinant virus-like particles of porcine circovirustype 2 capsid protein using ion-exchange monolith chromatography. J Chromatogr B. 2015, v. 991, p.21–28. doi:10.1016/j.jchromb.2015.04.004

Projektai ir bendradarbiavimas

Projektai:

  1. Nacionalinės mokslo programos kvietimo „Sveikas senėjimas“ projektas „Baltymų, siejamų su Alzheimerio ligos išsivystymu, sintezės reguliacijos tyrimai“, SEN-05/2015, 2015-2018 m. Vadovas prof. K. Sasnauskas.
  2. LMT mokslininkų grupių projektas „Sekreciją padidinančių lactis mutacijų tyrimai bei jų panaudojimas rekombinantinius baltymus supersekretuojančių mielių kamienų kūrimui“, 2017–2021 m. Vadovė prof. A. Gedvilaitė.
  3. LMT finansuojamas trišalis Lietuvos–Latvijos–Kinijos (Taivano) mokslo projektas „Žmogaus parvovirusų B19, HboV ir hPARV4 vaidmens uždegiminiuose neurologiniuose susirgimuose tarpdicisplininiai tyrimai“, Nr. TAP LLT-3/2017, 2017-2019 m. Vadovė dr. R. Petraitytė-Burneikienė.
  4. LMT projektas pagal 01.2.2-LMT-K-718 priemonės veiklą „Aukšto lygio tyrėjų grupių vykdomi moksliniai tyrimai“, (sumanioji specializacija) Nr. 01.2.2-LMT-K-718-01-0008 „Naujos technologijos rekombinantinių alergenų kūrimui“, 2018-2021 m. Vadovas prof. Gintautas Žvirblis.

 Sutartys su ūkio subjektais:

  • „Abcam Ltd“, Didžioji Britanija,
  • „Euroimmun AG“, Vokietija,
  • „Arc Dia International Oy Ltd“, Suomija,
  • UAB „Profarma“, Lietuva,
  • UAB „Baltymas“, Lietuva.

Bendradarbiavimas:

  • Friedrich-Loeffler-Institut Bundesforschungsinstitut für Tiergesundheit, Federal Research Institute for Animal Health OIE Collaborating Centre for Zoonoses in Europe (Vokietija)
  • Virusologijos skyrius, Freiburgo universitetas, Vokietija
  • Maxo Plancko  molekulinės augalų fiziologijos institutas, Vokietija
  • Virusologijos institutas, Slovakijos mokslų akademija, Slovakija 
  • Kirchensteino mikrobiologijos ir virusologijos institutas, Rygos Stradinio universitetas, Latvija
  • Medicininių tyrimų skyrius, Mackay Memorial ligoninė, Taivanas

Pasiekimai

Surasti ir identifikuoti keturi nauji pelėnų, geltonkaklės pelės ir kirstukų poliomos virusai.
Didelė per 40 skirtingų poliomos virusų VP1 baltymų VPD kolekcija (13 žmonių polyomos virusų, graužikų ir paukščių ir kitų gyvūnų), papilomos virusų L1 baltymų VPD kolekcija (HPV6, 16, 18, 31, 33), kiaulių 2 tipo cirko virusų kapsidės baltymų VPD.
Mielėse susintetinti tymų, kiaulytės, raudonukės, paragripo 1-4, 13 skirtingų hantavirusų nukleokapsidės, kiaulių parvoviruso, žmogaus bokavirusų 1-4, žmogaus parvoviruso 4, metapneumoviruso, hepatito E, galvijų Schmalenberg viruso baltymai.
Sukurti serologiniai diagnostikos testai, nustatyti specifiniams hantavirusų, įvairių parvovirusų ir paramyxo virusų antikūnams žmogaus serume ir seilėse.
Skyriuje sukurti tymų ir kiaulytės virusų baltymai įeina į komerciškai „Microimmune“ (Didžioji Britanija) firmos platinamus virusų diagnostikos rinkinius.
Mielėse susintetinti žmogaus šaperonai (kalretikulinas, BiP).
Mielių raiškos sistemos žiurkėno poliomos viruso chimerinių ir mozaikinių VPD konstravimui ir sintezei.
Genetiškai pakeistų mielių kamienų kolekcija rekombinantinių baltymų sintezei.
Lietuvos mokslo premija (2003 m.).
Patentas: Zvirblienė A., Gedvilaitė A., Ulrich, R., Sasnauskas. Process for the production of monoclonal antibodies using chimeric VLPs. US Patent No.:US7,919,314 B2. Apr. 5, 2011.
Patentinė paraiška: Čiplys E., Slibinskas R., Sasnauskas K., Michalak M., Gold L-I. Generation of native recombinant secreted human endoplasmic reticulum chaperones by using their native signal sequences in yeast expression systems. WO 2014/011723 A1.


Darbuotojai

EGE

Skyriaus vedėja dr. Rasa Petraitytė-Burneikienė
Tel. nr. 85234359, +370 670 13860
El. p. 

Dr. Asta Abraitienė
jaunesnioji mokslo darbuotoja
852234370

Dr. Aistė Bulavaitė
jaunesnioji mokslo darbuotoja 
852239431
 
Dr. Evaldas Čiplys
mokslo darbuotojas
852239432
Dr. Alma Gedvilaitė
vyriausioji mokslo darbuotoja
852234359
Dr. Vaiva Kazanavičiūtė
mokslo darbuotoja
  
Justas Lazutka
jaunesnysis mokslo darbuotojas 
852234359
 
Milda Norkienė
jaunesnioji mokslo darbuotoja 
852239434
 

Dr. Raimundas Ražanskas
mokslo darbuotojas
852239439 

Dr. Aušra Ražanskienė
vyresnioji mokslo darbuotoja 
852239440
 
Eglutė Rudokienė
chemikė tyrėja 
852234370
 
Prof. Kęstutis Sasnauskas
vyriausiasis mokslo darbuotojas, profesorius emeritas
852234361 
 

Dr. Rimantas Slibinskas
vyresnysis mokslo darbuotojas
852239432
 
Dr. Paulius Lukas Tamošiūnas
jaunesnysis mokslo darbuotojas
852234359
 
Rita Vorobjovienė
jaunesnioji mokslo darbuotoja
852239440
 

Dr. Mindaugas Zaveckas
jaunesnysis mokslo darbuotojas
852239431
 

Dr. Danguolė Žiogienė
jaunesnioji mokslo darbuotoja
852239434
 
Dr. Gintautas Žvirblis
vyresnysis mokslo darbuotojas
852234358
 
 

 

Doktorantai:

Edita Bakūnaitė
852239429 
 
Žilvinas Dapkūnas
852239435 
 
Juozas Nainys
852239400 
Neringa Macijauskaitė 
852239429
Gitana Mickienė
852239433 
 
Šarūnas Paškevičius
852239433 
 
Urtė Starkevič
852239439
 
Aliona Špakova
Monika Valavičiūtė 
 
Rūta Zinkevičiūtė
852239429
 
Eimantas Žitkus
852239432